６歳の息子が食事の途中で奥歯の歯茎が痛くなるようです。
（どこが痛いのか特定できず奥の歯茎が痛いと）
キーンとした痛みのようでしばらく痛みが続き、時間が経ったり
冷やしたりすると痛みは治まります。
学校の検診でも虫歯は認められず、あるようにはみえません。
早い時期に６歳きゅう歯が生え揃っています。
歯が痛いわけではないので歯医者に行くべきか悩みます。
何か他の病気も考えられるのでしょうか？
よろしくお願いいたします。

申し訳ありませんが文面からだけでは原因は特定できません。他の永久歯が生えてくる過程でのお痛みかもしれませんが、検診も含めて一度歯科医院を受診されてはいかがでしょうか。