虫歯（奥歯）の治療中で、その歯は根の部分以外はほとんどない状態です。神経は抜いてあって、治療中の歯のところに詰め物をかぶせていく段階なのですが、一回余分な歯茎を焼いて削らなければいけないということで削ったところ、見えてない部分が化膿しているような感じでかなりの激痛で頬のあたりも熱をもっているような状況です。今通院しているところでは「今触れない状態だ」といわれ、消毒をして抗生剤を飲んでいるのですが２週間位しても痛みが引きません。口の中のことなので知識もあまりなくされるがままなのですが、全然改善せず不安なまま通院しています。どんな状態になっているか考えられますでしょうか？

書いてある文から判断すると、根の治療を再度する必要があるのではないかと思います。
申し訳ございませんが、何度も書いてある質問文を読みましたが、理解できませんでした。
担当の先生にどうして痛いのか、分かりやすく説明していただくと良いと思います。