こんにちは。最近気付いたことなのですが私は親知らずが
上は2本生えていますが下は2本とも生えていません。
親知らずが生えはじめた頃から顎関節症の症状がでてきて
上の歯並びも悪いです。このような場合上の親知らずは
抜いた方がいいのでしょうか？

まずは歯科医院で診査してもらってください。必要があれば抜歯を勧められると思います。
実際問題として、おそらく抜歯してしまったほうが良いと私は考えますが、担当医とご相談の上お決めになられたら宜しいかと思います。