２週間前に右奥歯の上下親知らずのうち上の方を抜歯しました。
奥の方にできものが出来てその時は親知らずの影響だと言われました。そのあと色々忙しいのもありまして、下の親知らずは、まだ抜歯してません・・・

そうしているうちに、つい最近に、喉の奥の方に少し違和感があり、舌の奥の方（舌を下にして奥を）を見ると何やら横に腫れた物体ができています・・・これはナンなのでしょうか？
扁桃腺？でしょうか？よろしかったら教えてください。

口蓋扁桃の部分を言われているのではないかと思います。
口の奥の両側にある、アーモンドのような形をした親指大のリンパ腺のこぶで、のどの粘膜の中に埋まっています。
扁桃にはリンパ球が集まっており、細菌やビールスなどの異物を殺す働きがあります。風邪を引いたりすると腫れやすくなります。
親不知との関係は、お口の中を診ないと何とも言えません。