左上の親知らずを3日前に抜歯しました。
それから、噛み合わせが悪くなり、左の歯が長く感じ右の歯が短く感じ、うまく食べ物を噛めません。
親知らずの抜歯で噛みあわせに影響することってあるのでしょうか？

親知らずの抜歯で噛みあわせに影響することはよくありますが、かみ合わせが良くなることはあっても悪くなることはまれです。
まだ抜歯後３日目なのでもうしばらく経過をみる必要があると思います。
いずれ改善すると思います。